О.В. Гринева, Т.М. Усачева, В.И. Журавлев
Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, 119991 Москва, ул. Ленинские Горы, 1 ovg@phys.chem.msu.ru
Ключевые слова: Кембриджский банк структурных данных, квантово-химические расчеты, внутри- и межмолекулярные водородные связи, алифатические диолы
Страницы: 165-173 Подраздел: МАТЕРИАЛЫ XVI СИМПОЗИУМА ПО МЕЖМОЛЕКУЛЯРНОМУ ВЗАИМОДЕЙСТВИЮ И КОНФОРМАЦИЯМ МОЛЕКУЛ, 18-22 июня 2012 года, ИВАНОВО
Изучено строение восьми симметрически независимых молекул 2-метил-2,4-пентандиола (МПД) в шести кристаллических веществах на основе сведений, представленных в Кембриджском банке структурных данных (CSD). Координаты большей части атомов водорода в молекулах МПД не были определены экспериментально или не приведены в CSD, однако значения расстояний O…O позволяют сделать вывод об образовании внутримолекулярных водородных связей в четырех молекулах. Для выполнения квантово-химических расчетов отсутствующие атомы водорода были добавлены, при этом выбор положений атомов H в гидроксильных группах был основан на анализе возможностей образования внутри- и межмолекулярных водородных связей молекулами МПД в соответствующих кристаллах. Методом DFT с функционалом B3PW91 и базисным набором 6-31G(d,p) впервые проведены: 1) расчет дипольных моментов и энергий для молекул МПД в "кристаллических" конформациях; 2) оптимизация строения этих молекул с расчетом дипольных моментов для конформаций, соответствующих локальным минимумам энергии. Среди молекул с экспериментальными геометрическими параметрами наиболее выгодной оказалась одна из конформаций без внутримолекулярных водородных связей (μ = 0,56 Д). В результате минимизации энергии восьми "кристаллических" конформаций в вакууме получено пять энергетически разных конформеров. Среди них наименьшей энергией обладает конформер с внутримолекулярной водородной связью (μ = 3,53 Д). Ему соответствуют четыре варианта строения молекул в рассмотренных кристаллах, из которых два являются R- и два S-энантиомерами.
Наш сайт использует куки. Продолжая им пользоваться, вы соглашаетесь на обработку персональных данных в соответствии с политикой конфиденциальности. Подробнее
