5,6-Dihydrothymine (DHT) is a nucleobase lesion induced by the action of ionizing radiation on thymine residue in DNA. In this work, we present the hydrogen bonding base pairs involving 5,6-dihydrothymine bound to four bases in DNA: adenine (A), cytosine (C), guanine (G), and thymine (T). Full geometry optimizations are performed for the studied complexes by the B3LYP method. Interaction energies are corrected for the basis set superposition error, using the full Boys-Bernardi counterpoise correction scheme. Hydrogen bonding patterns of these base pairs are characterized using NBO and AIM analysis. According to the calculated binding energies and structural parameters, the stability of the base pairs decrease in the following order: DHT:G ~ DHT:A > DHT:C > DHT:T.
Л.Н. Мазалов1,2,3, Г.И. Семушкина1,3, С.А. Лаврухина1,3, Е.В. Коротаев1,3, Т.В. Басова1, А.И. Боронин4,2, Р.В. Гуляев4 1Институт неорганической химии им. А.В. Николаева СО РАН, Новосибирск spectroscopy@mail.ru 2Новосибирский государственный университет, 630090 Новосибирск, ул. Пирогова, 2 3Новосибирский государственный технический университет korotaev@niic.nsc.ru 4Институт катализа им. Г.К. Борескова СО РАН, 630090 Новосибирск, пр. Акад. Лаврентьева, 5
Ключевые слова: фталоцианины, рентгеновская эмиссионная спектроскопия, фотоэлектронная спектроскопия, модель переноса заряда
Страницы: 1074-1083
Проведено комплексное экспериментальное изучение рентгеноэлектронных Cu(2p3/2), Cu(2p1/2) и рентгеновских эмиссионных Kα1,2- и Lα1,2-спектров меди во фталоцианине меди CuPcH16 и его фторзамещенном аналоге CuPcF16. Для интерпретации спектров использовали модель переноса заряда. Показано, что Kα1- и Kα2-линии спин-дублета меди имеют сложную структуру, обусловленную процессами переноса заряда металл—лиганд. Выявлена роль сателлита в формировании эмиссионных линий.
А.Х. Мамлеев, Р.В. Галеев, М.Г. Файзуллин
Институт физики молекул и кристаллов Уфимского научного центра РАН mwsm@anrb.ru
Ключевые слова: транс- и цис-изомеры 2, 5-диметил-1, 3-диоксан, микроволновый спектр, конформация, дипольный момент, квантово-химические расчеты
Страницы: 1084-1089
Исследован микроволновый спектр 2,5-диметил-1,3-диоксана. В спектре идентифицированы вращательные переходы а- и с-типов транс- и цис-изомеров молекулы. По экспериментальным частотам переходов вычислены значения вращательных постоянных и квартичных констант центробежного искажения изомеров. Определены дипольные моменты. Выполнены квантово-химические расчеты методом функционала плотности B3PW91/aug-cc-pVDZ. Результаты расчетов сопоставлены с экспериментальными данными. Проведено сравнение равновесной геометрии 1,3-диоксана, 2-метил-, 5-метил- и 2,5-диметил-1,3-диоксанов. Установлено, что алкильное замещение приводит к изменению геометрии кольца.
Получен железо(III)содержащий комплекс с асимметричным тридентатным азометиновым лигандом 4,4'-додецилоксибензоилоксибензоил-4-салицилиден-N'-этил-N-этилендиамином с противоионом PF6- Наличие иона-комплексообразователя подтверждено Фурье-ИК спектрами в дальней области. Структура соединений установлена методом матрично-активированной лазерной десорбции/ионизации с времяпролетным анализатором (MALDI-ToF). Результаты масс-спектрометрических исследований согласуются с данными элементного анализа. Найдено, что реакция комплексообразования соли железа с асимметричным тридентатным лигандом приводит к получению соединений состава 1:1 с октаэдрической упаковкой иона металла в комплексе. Исследовано электрохимическое поведение соединения в органических растворителях. Методом ЭПР показано, что ионы железа(III) в комплексе находятся как в низкоспиновом (НС), так и высокоспиновом (ВС) состояниях. НС и ВС центры железа(III) связаны в димерную структуру, в которой молекула воды и противоион PF6- выполняют роль соединительных мостиков. Установлено также, что для НС комплексов, находящихся в низкотемпературной фазе (4,2—300 K), электронное состояние (dxz, dyz)4(dxy)1 является основным. Обнаружено, что перевод образца в высокотемпературную жидкокристаллическую (387—405 K) фазу сопровождается конверсией НС состояний иона Fe(III) (dxz, dyz)4(dxy)1 ↔ (dxy)2(dxz, dyz)3. Переключение НС состояний обратимо по температуре и управляется температурой. Данные рентгеноструктурного анализа подтверждают, что полученное соединение состоит из димеров, образованных за счет водородной (O—H⋯F) связи.
J. Tong, Y. Chen, S. Liu, X. Xu, F. Cheng
Shaanxi University of Science and Technology, PR China Jianbotong@yahoo.com.cn
Ключевые слова: quantitative structure-spectrum relationship (QSSR), 13C NMR chemical shifts of alcohols and thiols, atomic ionicity index (INI), polarizability effect index (PEI), stereoscopic effect parameters (Оµ)
Страницы: 1102-1106
Quantitative structure-spectrum relationship calculations of 13C NMR chemical shifts of both 302 carbon atoms in 56 alcohols and 62 carbon atoms in 15 thiols are described using several parameters: the atomic ionicity index (INI), the polarizability effect index (PEI), and stereoscopic effect parameters (ε) of the compounds. The 13C NMR chemical shifts for these compounds of both alcohols and thiols can be estimated through the multiple linear regression (MLR). A MLR model was built with variable screening by the stepwise multiple regression and examined by validation on its stability. The correlation coefficient of the established model as well as the leave-one-out cross-validation was 0.9724 and 0.9716 respectively. The results obviously indicate that INI and e are linearly related with 13C NMR chemical shifts, which provides a new method for calculating 13C NMR chemical shifts in the compounds of both alcohols and thiols.
Методом УФ спектроскопии в различных растворителях определены молярные коэффициенты поглощения фуллерена С60 и монозамещенных 1,2-дигидро-С60-фуллеренов. Установлено, что коэффициент экстинкции фуллерена С60 при 330 нм (основная полоса поглощения, наиболее часто используемая для количественного и качественного определения содержания С60) не зависит от природы растворителя и составляет ~54400 М –1×см –1. Молярные коэффициенты поглощения ряда монозамещенных 1,2-дигидро-С60-фуллеренов практически не зависят от химического строения, длины заместителя и составляют 35700 М –1×см –1 (λ ~ 328 нм) и 115250 М –1×см –1 (λ ~ 257 нм). Показано, что замещение в фуллерене происходит по двойной 6,6 связи, о чем свидетельствует характеристичная для монозамещенных метанофуллеренов полоса поглощения при 424 нм в спектрах этих соединений.
В.Н. Карцев1, С.Н. Штыков1, К.Е. Панкин1, Д.В. Батов2 1Саратовский государственный университет им. Н.Г. Чернышевского texmexium@mail.ru 2Институт химии растворов РАН им. Г.А. Крестова, Иваново batov@isuct.ru
Ключевые слова: межмолекулярные силы, внутреннее давление
Страницы: 1113-1118
Решена задача о введении термина ”внутреннее давление” с позиций межмолекулярных сил. Показано: внутреннее давление создается усредненным по макросистеме собственным силовым полем структурных единиц жидкости; внутреннее давление — это не энергетическая, а усредненная по макросистеме силовая характеристика взаимодействия структурных единиц жидкофазной системы, хотя и имеет размерность плотности энергии — [Дж/м3].
С.А. Громилов1,2, А.В. Алексеев1,2, С.А. Кинеловский3,2 1Институт неорганической химии им. А.В. Николаева СО РАН, Новосибирск, grom@niic.nsc.ru 2Новосибирский государственный университет, Новосибирск 3Институт гидродинамики им. М.А. Лаврентьева СО РАН, Новосибирск
Ключевые слова: молибден, карбид, кумулятивный синтез, покрытие, рентгенофазовый анализ
Страницы: 1125-1128
Изучены особенности структуры и фазового состава покрытий, полученных в условиях кумулятивного взрыва. В качестве предшественников использованы различные молибденсодержащие соединения.
Определена молекулярная и кристаллическая структура галогензамещенных ацетилацетонатов дифторида бора: 2,2-дифтор-5-хлор-4,6-диметил-1,3,2-диоксаборина (1) и 2,2-дифтор-5-бром-4,6-диметил-1,3,2-диоксаборина (2). В обоих соединениях существует заметное межмолекулярное взаимодействие между атомами фтора и атомами углерода хелатного цикла, а также между атомами фтора и заместителями. Для объяснения выявленных закономерностей упаковки молекул рассчитано распределение зарядов в исследованных хелатах.
Л.А. Глинская1, З.А. Савельева1, С.В. Ларионов1, С.Н. Бизяев2, А.В. Ткачев2 11Институт неорганической химии им. А.В. Николаева СО РАН, Новосибирск glinsk@niic.nsc.ru 2Новосибирский институт органической химии им. Н.Н. Ворожцова СО РАН, 630090 Новосибирск, пр. Акад. Лаврентьева, 9
Ключевые слова: комплекс, сольват, цинк(II), бис(ментановый) пропилендиаминодиоксим, структура
Страницы: 1135-1140
Выращены монокристаллы и по данным РСА (150 K, автодифрактометр Bruker X8 Apex CCD, МоKa-излучение) определена кристаллическая структура сольвата — соединения [Zn(НL)Cl]×EtOH. Кристаллы триклинные, размеры элементарной ячейки: a = 7,4755(4), b = 13,9701(11), c = 14,4593(19) Å, α = 82,277(2), β = 75,410(2), γ = 75,356(1)°, пр. гр. Р1. В структуре сольвата содержатся две кристаллографически независимые молекулы комплекса [Zn(НL)Cl] и две некоординированные молекулы этанола. Ионы Zn2+ в каждой молекуле координируют атомы N тетрадентатных хелатообразующих лигандов — анионов НL– и атом Cl. Полиэдры ClN4 — искаженные тетрагональные пирамиды. Молекулы EtOH образуют с молекулами комплексов H-связи, способствующие образованию цепочек вдоль оси х .