Л.А. Грибов, Б.К. Новосадов
Институт геохимии и аналитической химии им В.И. Вернадского РАН, ул. Косыгина, 19, Москва 119991 l_gribov@mail.ru
Ключевые слова: уравнение Шредингера, гамильтониан молекулы, квантовая химия, численное решение
Страницы: 245-250 Подраздел: ТЕОРИЯ СТРОЕНИЯ МОЛЕКУЛ И ХИМИЧЕСКОЙ СВЯЗИ
Описан алгоритм численного решения предложенного в [1—5] уравнения Шредингера, в котором оператор электронно-ядерного взаимодействия имеет интегральную форму по ядерному распределению, а само уравнение записывается в разделяющихся переменных электронов и ядер.
Методом рентгеновской дифракции установлена кристаллическая и молекулярная структура квазигерматрандиола (HO)2Ge(OCH2CH2)2NH при 155 K. Квантово-химическим методом с использованием теории возмущения Меллера—Плессе второго порядка (MP2) и валентно-расщепленного базисного набора с поляризационными и диффузными функциями для всех типов атомов 6-311++G(d,p) рассчитаны структурные параметры этой молекулы. В кристалле молекулы квазигерматрандиола объединены в колонки за счет водородных связей O—H⋯O и N—H⋯O средней силы. Колонки между собой объединяются за счет слабых водородных связей O—H⋯O и N—H⋯O. Методом калориметрии установлен фазовый переход в кристалле квазигерматрандиола при 150—145 K.
Т.Н. Дребущак1,2, Е.В. Болдырева1,2, К. Фуке3,4 1Институт химии твердого тела и механохимии СО РАН, Ул. Кутателадзе, 18, Новосибирск, Новосибирская область, 630128 tanya@xray.nsu.ru 2НОЦ "Молекулярный дизайн и экологически безопасные технологии" при Новосибирском государственном университете, Ул. Пирогова, 2, Новосибирск, 630090 3Химический факультет Университета Дарэма, Великобритания 4Институт фармации Университета Инсбрука, Австрия
Ключевые слова: катехоловые соединения, водородные связи, дигидрокофеиновая кислота, рентгеноструктурный анализ
Страницы: 306-311 Подраздел: СТРУКТУРА БИОЛОГИЧЕСКИ АКТИВНЫХ СИСТЕМ
Дигидрокофеиновая кислота, С9H10O4, относится к группе природных антиоксидантов. Впервые определена кристаллическая структура дигидрокофеиновой кислоты, кристаллографические данные при 100 K: a = 11,3189(4), b = 5,5824(1), c = 13,8431(4) Å, b = 109,248(4)°, V = 825,80(4) Å3, пространственная группа P21/c, Z = 4. Помимо образования обычных для кислот водородных связей, присутствуют некоторые особенности, важные с точки зрения реакционной способности молекул дигидрокофеиновой кислоты. Положение одного из атомов водорода гидроксила катехоловой группы даже при 100 K разупорядочено. В кристаллической структуре кофеиновой кислоты такого разупорядочения не наблюдается.
Е.Е. Нетреба, А.М. Федоренко
Таврический национальный университет им. В.И. Вернадского, Просп. Вернадского, 4, Симферополь, АР Крым, Украина, 95000 evgtnu@gmail.com
Ключевые слова: марганец(II), спирокарбон, координационный полимер, кристаллическая структура, РСА
Страницы: 312-316 Подраздел: СТРУКТУРА БИОЛОГИЧЕСКИ АКТИВНЫХ СИСТЕМ
Синтезирован координационный полимер {[Mn(H2O)2(C11H20N4O2)2]2+⋅2(NO3–)}n и определена его структура. Кристаллы моноклинные: пр. гр. P21/c, a = 12,3771(3), b = 14,8775(3), c = 18,1388(4) Å, β = 106,611(2)°, V = 3200,70(12) Å3, dвыч = 1,44 г/см3, Z = 4. Ионы марганца координированы четырьмя атомами кислорода четырех органических лигандов (два из которых являются симметрически независимыми), а также двумя молекулами воды. Координационный полиэдр представляет собой искаженный октаэдр, углы О—Mn—O между соседними атомами кислорода варьируются в диапазоне 83,96(5)—98,11(5)°. Нитрат-анионы находятся во внешней координационной сфере комплекса. Расстояния Mn…Mn в полимере составляют 8,56 Å. Полимерные координационные цепочки в кристалле связаны в слои, перпендикулярные оси b, за счет серии межмолекулярных водородных связей между органическими лигандами, молекулами воды и нитрат-анионами.
Синтезировано новое соединение EnrH3[SnBr3,46Cl2,54]⋅H2O, EnrH32+ — катион энрофлоксациния (C19H24FN3O32+) и определена его кристаллическая и молекулярная структура. Кристаллографические данные моногидрата тетрабромидодихлоридостанната(IV) энрофлоксациния: a = 17,1262(19), b = 10,3435(11), с = 17,2582(19) Å, β = 119,203(1)°, V = 2640,5(4) Å3, пр. гр. P21/c, Z = 4. Водородные связи образуют разветвленную трехмерную сеть, связывая EnrH32+, [SnBr3,46Cl2,54]2– и молекулы воды. Структура также стабилизирована π—π-взаимодействием ароматических колец EnrH32+.
И.М. Сахаутдинов1, И.Р. Батыршин1, А.А. Фатыхов1, В.М. Юмабаева2, К.Ю. Супоницкий3, М.Ю. Антипин3, М.С. Юнусов1 1Институт органической химии УНЦ РАН, Уфа ioh039@mail.ru 2Башкирский государственный университет, Уфа viliya09@rambler.ru 3Институт элементоорганических соединений им. Несмеянова РАН, Ул. Вавилова, 28, Москва, 119334
Ключевые слова: метил 4-[(1,3-диоксо-1,3-дигидро-2H-изоиндол-2-ил)метил]-1-метил-1H-пиразол-5-карбоксилат, метил 4-[(1,3-диоксо-1,3-дигидро-2H-изоиндол-2-ил)метил]-1-метил-1H-пиразол-3-карбоксилат, ЯМР спектрометрия, рентгеноструктурный анализ
Страницы: 323-327 Подраздел: СТРУКТУРА БИОЛОГИЧЕСКИ АКТИВНЫХ СИСТЕМ
Методом рентгеноструктурного анализа определено строение метил 4-[(1,3-диоксо-1,3-дигидро-2H-изоиндол-2-ил)метил]-1-метил-1H-пиразол-5-карбоксилата, на основе которого идентифицирована структура метил 4-[(1,3-диоксо-1,3-дигидро-2H-изоиндол-2-ил)метил]-1-метил-1H-пиразол-3-карбоксилата с использованием данных гомо- и гетероядерной двумерной корреляционной спектроскопии ЯМР.
На примере многослойных нанотрубок MoS2 обсуждены возможности метода рентгеновской дифракции в определении возможных политипных форм слоистых дихалькогенидов металлов, которые могут возникать при наноструктурировании данных соединений. Сделан вывод о малой информативности метода рентгеновской дифракции, поэтому экспериментальный анализ политипного состава наноструктур дихалькогенидов металлов требует привлечения методов электронной микроскопии и электронной томографии.
Л.Ю. Изотова1, Д.М. Ашуров1, С.А. Талипов1, Б.Т. Ибрагимов1, Э. Вебер2 1Институт биоорганической химии им. А.С. Садыкова АН РУз, Ул. Академика Х. Абдуллаева, 83, Ташкент, 700143 l_izotova@yahoo.com 2Институт органической химии Технического университета горной академии, Фрейберг, Германия
Ключевые слова: 1,1'-бинафтил-2,2'-бикарбоновая кислота, полиморфизм сольватообразования, 2-пиколин, кристаллическая структура
Страницы: 339-345 Подраздел: СУПРАМОЛЕКУЛЯРНЫЕ И НАНОРАЗМЕРНЫЕ СИСТЕМЫ
Из растворов в 2-пиколине (2-метилпиридине) в зависимости от температуры кристаллизации универсальный клатратоген — 1,1'-бинафтил-2,2'-бикарбоновая кислота (ББК) — осаждается в виде кристаллов трех типов различного состава и строения: при обычных условиях (комнатная температура) образуются кристаллы дисольвата ББК с 2-пиколином, при понижении температуры на 20 °C кристаллизуется дигидрат моносольвата, а при повышении температуры на такую же величину — моносольват, т.е. по мере увеличения температуры кристаллизации количество включаемых гостевых молекул постепенно уменьшается и пространство, в котором они располагаются, становится более замкнутым. В сольвате ББК/2-пиколин/H2O состава 1:1:2 (пр. гр. P21/n, a = 11,991(2), b = 9,317(2), c = 22,283(5) Å, β = 99,77(3)°, V = 2453,3(9) Å3, Z = 4) карбоксильные группы молекулы ББК при атоме С21 депротонированы и освободившийся протон переходит к атому азота 2-пиколина. Молекулы ББК вместе с молекулами 2-пиколина и воды посредством Н-связей образуют бесконечные цепочки в направлении [111], которые, в свою очередь, сшиваются в бесконечные двухмерные слои, параллельные плоскости (–101). Молекулы 2-пиколина находятся в каналах. В дисольвате ББК/2-пиколин (пр. гр. С2/с, a = 11,7523(11), b = 13,8563(13), c = 17,9615(13) Å, β = 108,044(9)°, V = 2781,1(4) Å3, Z = 4) одна молекула ББК и две молекулы 2-пиколина, связанные через водородную связь, образуют 0-мерный ассоциат типа G—H—G. Молекулы растворителя также расположены в каналах. В моносольвате ББК/2-пиколин (пр. гр. P21/с, a = 9,299(5), b = 12,727(5), c = 19,011(5) Å, β = 95,248(5)°, V = 2240,5(16) Å3, Z = 4) каждая молекула ББК Н-связана с молекулой 2-пиколина, образуя 0-мерный ассоциат типа H—G. Гостевые молекулы расположены в закрытых полостях.
Представлен краткий обзор работ по кристаллохимическим особенностям строения и способам описания структурных типов кристаллов. Предложен вариант универсальной системы символьного описания структурных типов кристаллов и модулярных структур с помощью структурных кодов. В основу структурного кода заложено описание геометрии и топологии базового модуля структуры. Структурные коды предназначены для идентификации и систематизации структурных типов веществ, формализации топологических преобразований структур, определения структурных модулей и выявления генетических взаимосвязей между структурами.
Наш сайт использует куки. Продолжая им пользоваться, вы соглашаетесь на обработку персональных данных в соответствии с политикой конфиденциальности. Подробнее