Издательство СО РАН

Издательство СО РАН

Адрес Издательства СО РАН: Россия, 630090, а/я 187
Новосибирск, Морской пр., 2

soran2.gif

Baner_Nauka_Sibiri.jpg


Яндекс.Метрика

Array
(
    [SESS_AUTH] => Array
        (
            [POLICY] => Array
                (
                    [SESSION_TIMEOUT] => 24
                    [SESSION_IP_MASK] => 0.0.0.0
                    [MAX_STORE_NUM] => 10
                    [STORE_IP_MASK] => 0.0.0.0
                    [STORE_TIMEOUT] => 525600
                    [CHECKWORD_TIMEOUT] => 525600
                    [PASSWORD_LENGTH] => 6
                    [PASSWORD_UPPERCASE] => N
                    [PASSWORD_LOWERCASE] => N
                    [PASSWORD_DIGITS] => N
                    [PASSWORD_PUNCTUATION] => N
                    [LOGIN_ATTEMPTS] => 0
                    [PASSWORD_REQUIREMENTS] => Пароль должен быть не менее 6 символов длиной.
                )

        )

    [SESS_IP] => 3.88.114.76
    [SESS_TIME] => 1711692000
    [BX_SESSION_SIGN] => 9b3eeb12a31176bf2731c6c072271eb6
    [fixed_session_id] => 8019efae057bf8562d53e1462f279c02
    [UNIQUE_KEY] => 2f4e2835600d8a19cfd90c5bbee703c6
    [BX_LOGIN_NEED_CAPTCHA_LOGIN] => Array
        (
            [LOGIN] => 
            [POLICY_ATTEMPTS] => 0
        )

)

Поиск по журналу

Сибирский лесной журнал

2014 год, номер 4

1.
О МЕЖДУНАРОДНОМ СОВЕЩАНИИ–СЕМИНАРЕ

А.А. Онучин
Институт леса им. В. Н. Сукачева СО РАН, Академгородок, 50/28, Красноярск, 660036
onuchin@ksc.krasn.ru
Страницы: 5-8
Подраздел: ОТ ГЛАВНОГО РЕДАКТОРА

Аннотация >>
Четвертый номер «Сибирского лесного журнала» тематический, в нем представлены материалы первого Международного совещания-семинара «Молекулярная генетика в практике лесного хозяйства: состояние, проблемы и перспективы применения», состоявшегося в мае 2014 г. в Москве на базе Российского центра защиты леса при поддержке Федерального агентства лесного хозяйства.


2.
О ПРОВЕДЕНИИ ВПЕРВЫЕ МЕЖДУНАРОДНОГО ГЕНЕТИЧЕСКОГО СОВЕЩАНИЯ–СЕМИНАРА

В.В. Солдатов1, К.В. Крутовский2,3,4,5
1Российский центр защиты леса, 141207, Московская обл., Пушкино, ул.Надсоновская, д.13
rcfh.cancz@yandex.ru
2Сибирский федеральный университет, 660036, Красноярск, Академгородок, 50а/2
kkrutovsky@gmail.com
3Институт общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН, 119991, ГСП-1, Москва, ул. Губкина, 3
4Геттингенский университет, Германия, 37077, Геттинген, ул. Бюсгенвег, 2
5Техасский агро-механический университет, США, 77843, Техас, Колледж Стейшн
Страницы: 9-10
Подраздел: ВСТУПЛЕНИЕ К СПЕЦИАЛЬНОМУ ВЫПУСКУ ЖУРНАЛА

Аннотация >>
В Москве 28-29 мая 2014 г. Российский центр защиты леса («Рослесозащита») при поддержке Федерального агентства лесного хозяйства (Рослесхоз) впервые провел международное генетическое совещание-семинар «Молекулярная генетика в практике лесного хозяйства: состояние, проблемы и перспективы применения» с привлечением широкого круга специалистов по лесной генетике, геномике и биотехнологии, хозяйственников-производственников, руководителей лесных федеральных агентств и академических институтов преимущественно Российской Федерации (РФ) и Беларуси.


3.
ПЕРСПЕКТИВЫ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ ГЕНОМНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ В ЛЕСНОМ ХОЗЯЙСТВЕ

К.В. Крутовский1,2,3,4
1Сибирский федеральный университет, 660036, Красноярск, Академгородок, 50а/2
kkrutovsky@gmail.com
2Институт общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН, 119991, ГСП-1, Москва, ул. Губкина, 3
3Геттингенский университет, Германия, 37077, Геттинген, ул. Бюсгенвег, 2
4Техасский агро-механический университет, США, 77843, Техас, Колледж Стейшн
Ключевые слова: геном, de novo секвенирование, лиственница сибирская (Larix sibirica Ledeb.), сосна кедровая сибирская (Pinus sibirica Du Tour), сосна обыкновенная (Pinus sylvestris L.), бореальные леса, фитопатогены, лесное хозяйство
Страницы: 11-15
Подраздел: ОБЩИЕ ВОПРОСЫ ЛЕСНОЙ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ И БИОТЕХНОЛОГИИ

Аннотация >>
Хвойные являются ключевыми видами бореальных экосистем. Полное секвенирование, сборка и аннотация генома хвойных позволят понять эволюцию этого очень непростого и древнего генома, имеющего гигантский размер, который, например, у лиственниц в 4 раза, а у сосен — в 7–9 раз превышает геном человека. Геномные исследования позволят получить важную информацию и разработать высокоинформативные молекулярно–генетические маркеры, такие как микросателлиты и однонуклеотидные полиморфизмы (SNPs), которые могут быть эффективно использованы для определения происхождения древесины, изучения и мониторинга генетической изменчивости хвойных лесов, их адаптации к изменению климата и для создания селекционных и природоохранных программ.


4.
ПРИМЕНЕНИЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ МЕТОДОВ В ЛЕСНОМ ХОЗЯЙСТВЕ БЕЛАРУСИ

В.Е. Падутов, О.Ю. Баранов, Д.И. Каган, О.А. Ковалевич, М.Я. Острикова, С.В. Пантелеев, С.И. Ивановская, Д.В. Кулагин
Институт леса Национальной академии наук Беларуси, Республика Беларусь, 246001, Гомель, ул. Пролетарская, 71
forestgen@mail.ru
Ключевые слова: молекулярная генетика, лесное хозяйство, плантационное и популяционное семеноводство, селекция, фитопатологический мониторинг, посадочный материал, Республика Беларусь
Страницы: 16-20
Подраздел: ОБЩИЕ ВОПРОСЫ ЛЕСНОЙ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ И БИОТЕХНОЛОГИИ

Аннотация >>
Представлены результаты молекулярно-генетических исследований, выполненных сотрудниками Института леса Национальной академии наук Беларуси. Приведены примеры их практического использования в лесном хозяйстве Беларуси.


5.
РАЗРАБОТКА ЦИТОПЛАЗМАТИЧЕСКИХ SSR-МАРКЕРОВ ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЙ СОСНЫ КЕДРОВОЙ СИБИРСКОЙ (PINUS SIBIRICA DU TOUR)

Е.А. Шилкина1, Н.В. Орешкова2,3, А.А. Ибе1,3, К.О. Дейч1,3, К.В. Крутовский3,4,5,6
1Центр защиты леса Красноярского края, 660036, Красноярск, Академгородок, 50а/2
helenbeauty74@mail.ru
2Институт леса им. В. Н. Сукачева СО РАН, 660036, Красноярск, Академгородок, 50/28
oreshkova@ksc.krasn.ru
3Сибирский федеральный университет, 660036, Красноярск, Академгородок, 50а/2
aaibis@mail.ru
4Институт общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН, 119991, ГСП-1, Москва, ул. Губкина, 3
kkrutovsky@gmail.com
5Геттингенский университет, Германия, 37077, Геттинген, ул. Бюсгенвег, 2
6Техасский агро-механический университет, США, Техас, 77843, Колледж Стейшн
Ключевые слова: ПЦР, хлоропластные и митохондриальные маркеры, митотип, локус, аллель, гаплотип, сосна кедровая сибирская (Pinus sibirica Du Tour)
Страницы: 21-24
Подраздел: ОБЩИЕ ВОПРОСЫ ЛЕСНОЙ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ И БИОТЕХНОЛОГИИ

Аннотация >>
Разработаны три хлоропластных и один митохондриальный ДНК–маркеры для генотипирования сосны кедровой сибирской (Pinus sibirica Du Tour). По результатам генотипирования 60 деревьев из двух популяций два хлоропластных локуса оказались мономорфными и один — полиморфным с двумя аллелями. Таким образом, всего для хлоропластных локусов выявлено два гаплотипа. Для митохондриального маркера также выявлено два аллеля, или гаплотипа (митотипа).


6.
О ВЗАИМОСВЯЗИ ГЕНЕТИЧЕСКИХ И СЕЛЕКЦИОННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ ЛЕСНЫХ ДРЕВЕСНЫХ РАСТЕНИЙ

Л.И. Милютин
Институт леса им. В. Н. Сукачева СО РАН, 660036, Красноярск, Академгородок, 50/28
milyutin@ksc.krasn.ru
Ключевые слова: генетика, селекция, фенетика, полиморфизм, географическая изменчивость, лесные древесные растения
Страницы: 25-28
Подраздел: ОБЩИЕ ВОПРОСЫ ЛЕСНОЙ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ И БИОТЕХНОЛОГИИ

Аннотация >>
Рассмотрены актуальные и нерешенные проблемы взаимосвязи генетических и селекционных исследований лесных древесных растений. В частности, анализируются недостатки изучения изоэнзимного и ДНК–полиморфизма. Обсуждаются задачи, направленные на объединение исследований лесных генетиков и селекционеров.


7.
ПРИМЕНЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ ФЕНОГЕОГРАФИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ В ПРАКТИКЕ ЛЕСНОГО ХОЗЯЙСТВА РОССИИ

А.И. Видякин
Институт биологии Коми научного центра УрО РАН, 610035, Киров, ул. Некрасова, 65
les@aiv.kirov.ru
Ключевые слова: сосна обыкновенная, популяция, феногеографические исследования, применение результатов исследований в лесном хозяйстве, Россия
Страницы: 29-34
Подраздел: ОБЩИЕ ВОПРОСЫ ЛЕСНОЙ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ И БИОТЕХНОЛОГИИ

Аннотация >>
Рассмотрены основные результаты феногеографических исследований популяционно-хорологической структуры сосны обыкновенной (Pinus sylvestris L.) на Русской равнине, в Южном Зауралье и возможные направления их применения в практике лесного хозяйства России. Даны рекомендации использовать получаемые в итоге этих исследований карты-схемы пространственного расположения популяций при разработке лесосеменного районирования вида. Предложена система лесоводственно-хозяйственных мероприятий по восстановлению генетической изменчивости и эволюционно-генетических процессов в популяциях.


8.
ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ ДЛЯ АНАЛИЗА НАЛИЧИЯ ФИТОПАТОГЕНОВ В ЛЕСНЫХ НАСАЖДЕНИЯХ И ПИТОМНИКАХ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ

Т.С. Алимова1, В.А. Сиволапов2, Н.А. Карпеченко2, О.К. Шишкина1, С.В. Пантелеев3, О.А. Ковалевич3
1Российский центр защиты леса, 141200, Московская обл., Пушкино, ул. Надсоновская, 13
shok3011@yandex.ru
2Центр защиты леса Воронежской области, 394000, Воронеж, ул. Ломоносова, 105
vladimir-sivolapov@yandex.ru
3Институт леса Национальной академии наук Беларуси, Республика Беларусь, 246001, Гомель, ул. Пролетарская, 71
stasikdesu@mail.ru
Ключевые слова: фитопатогены, анализ ДНК фитопатогенов, Ризина волнистая (Rhizina undulata Fr. 1815), корневая губка (Heterobasidion annosum (Fr.) Breff 1889), фузариозы, фомозы, лесные насаждения, лесные питомники, Российская Федерация
Страницы: 35-41
Подраздел: ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ ДЛЯ РЕШЕНИЯ ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПРИКЛАДНЫХ ЗАДАЧ ЛЕСНОЙ ЭНТОМОЛОГИИ И ФИТОПАТОЛОГИИ

Аннотация >>
Приведены результаты применения методов молекулярной генетики для анализа наличия фитопатогенов в лесных насаждениях и питомниках Российской Федерации, в том числе Ризины волнистой (Rhizina undulata Fr. 1815) и корневой губки (Heterobasidion annosum (Fr.) Breff 1889). Обсуждаются перспективы и преимущества использования ДНК–анализа для ранней диагностики заболеваний растений без выделения патогена в чистую культуру, сокращения сроков исследования, возможности проведения массовых обследований и др.


9.
МОЛЕКУЛЯРНАЯ ФИТОПАТОЛОГИЯ: СОВРЕМЕННЫЕ ПОДХОДЫ И ОСНОВНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ ДИАГНОСТИКИ БОЛЕЗНЕЙ ДРЕВЕСНЫХ РАСТЕНИЙ

О.Ю. Баранов
Институт леса Национальной академии наук Беларуси, Республика Беларусь, 246001, Гомель, ул. Пролетарская, 71
betula-belarus@mail.ru
Ключевые слова: молекулярная фитопатология, фитопатоген, ДНК-маркеры, эпифитотия, древесные растения
Страницы: 42-45
Подраздел: ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ ДЛЯ РЕШЕНИЯ ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПРИКЛАДНЫХ ЗАДАЧ ЛЕСНОЙ ЭНТОМОЛОГИИ И ФИТОПАТОЛОГИИ

Аннотация >>
Рассмотрены перспективы диагностики болезней древесных растений современными методами молекулярной фитопатологии. Описан метагеномный подход, основанный на анализе комплекса возбудителей, включая непатогенную микрофлору. Предложено использование мультикопийных универсальных локусов, характеризующихся некоторыми преимуществами при определении таксономической принадлежности инфекционных агентов в ходе молекулярно-фитопатологического анализа.


10.
МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ДИАГНОСТИКА ВОЗБУДИТЕЛЕЙ МИКОЗОВ ЛЕСНОГО ПОСАДОЧНОГО МАТЕРИАЛА, ПЕРЕНОСИМЫХ НАСЕКОМЫМИ

С.В. Пантелеев, О.Ю. Баранов
Институт леса Национальной академии наук Беларуси, Республика Беларусь, 246001, Гомель, ул. Пролетарская, 71
stasikdesu@mail.ru
Ключевые слова: ДНК, ПЦР, посадочный материал, Cladosporium, Alternaria
Страницы: 46-49
Подраздел: ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ ДЛЯ РЕШЕНИЯ ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПРИКЛАДНЫХ ЗАДАЧ ЛЕСНОЙ ЭНТОМОЛОГИИ И ФИТОПАТОЛОГИИ

Аннотация >>
Рассмотрены аспекты применения молекулярно-генетических методов в диагностике видового состава микромицетов в тканях насекомых с целью выяснения роли последних в качестве переносчиков возбудителей основных заболеваний древесных видов в лесных питомниках. Установлено, что насекомые являются одним из потенциальных факторов переноса и распространения ряда фитопатогенных грибов, в частности представителей родов Cladosporium и Alternaria.


11.
ЦИТОЛОГИЧЕСКИЕ, МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ И ЛЕСОВОДСТВЕННО-СЕЛЕКЦИОННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ ПОЛИПЛОИДНЫХ ТОПОЛЕЙ

А.И. Сиволапов1, Д.В. Политов2, О.С. Машкина3, М.М. Белоконь2, В.А. Сиволапов4, Ю.С. Белоконь2, Т.М. Табацкая5
1Воронежская государственная лесотехническая академия, 394087, Воронеж, ул. Тимирязева, 8
Aleksey-Sivolapov@yandex.ru
2Институт общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН, 119991, Москва, ул. Губкина, 3
Dmitri_p@inbox.ru
3Воронежский государственный университет, 394006, Воронеж, Университетская площадь, 1
olga_mashkina@yahoo.com
4Центр защиты леса Воронежской области, 394087, Воронеж, ул. Ломоносова, 105
Vladimir-Sivolapov@yandex.ru
5Всероссийский НИИ лесной генетики, селекции и биотехнологии, 394087, Воронеж, ул. Ломоносова, 105
Ключевые слова: тополь, осина, полиплоиды, числа хромосом, ДНК-анализ, продуктивность культур тополя
Страницы: 50-58
Подраздел: ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ ОБЪЕКТОВ ЛЕСНОГО ГЕНЕТИКО-СЕЛЕКЦИОННОГО КОМПЛЕКСА

Аннотация >>
Рассмотрены результаты цитологических, лесоводственно-селекционных исследований и ДНК-анализа полиплоидных тополей. У клонов тополя изучены продуктивность, числа хромосом, проведены подбор и тестирование микросателлитных локусов для генетической паспортизации посадочного материала. Исследование показало высокую эффективность диагностики видов, индивидуальных генотипов и клонов внутри видов и гибридов на основе генных маркеров полиморфизма микросателлитной ДНК.


12.
ЭФФЕКТИВНОСТЬ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ ОБЪЕКТОВ ПОСТОЯННОЙ ЛЕСОСЕМЕННОЙ БАЗЫ ДЛЯ СОХРАНЕНИЯ ГЕНОФОНДА СОСНЫ ОБЫКНОВЕННОЙ В БЕЛАРУСИ

С.И. Ивановская
Институт леса Национальной академии наук Беларуси, Республика Беларусь, 246001, Гомель, ул. Пролетарская, 71
isozyme@mail.ru
Ключевые слова: сосна обыкновенная, постоянная лесосеменная база, изоферментный анализ, сохранение генофонда, Республика Беларусь
Страницы: 59-63
Подраздел: ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ ОБЪЕКТОВ ЛЕСНОГО ГЕНЕТИКО-СЕЛЕКЦИОННОГО КОМПЛЕКСА

Аннотация >>
На основе метода электрофоретического анализа изоферментов проведены исследования объектов постоянной лесосеменной базы сосны обыкновенной в Беларуси. Выявлено, что практически все проанализированные плюсовые насаждения, генетические резерваты, лесосеменные плантации I порядка, географические культуры и до 71.5 % лесосеменных плантаций II порядка сохраняют уровень средней гетерозиготности, характерный для сосны обыкновенной в Беларуси. Показано, что в ходе плантационного и популяционного семеноводства можно при повышении продуктивности создаваемых лесных культур обеспечить сохранение видового генофонда.


13.
ИЗМЕНЧИВОСТЬ ГАПЛОТИПОВ ЦИТОПЛАЗМАТИЧЕСКОЙ ДНК ЕЛИ ЕВРОПЕЙСКОЙ В ГЕОГРАФИЧЕСКИХ КУЛЬТУРАХ

В.Е. Падутов, А.И. Сидор, Д.И. Каган, О.А. Ковалевич, С.Н. Верас
Институт леса Национальной академии наук Беларуси, Республика Беларусь, 246001, Гомель, ул. Пролетарская, 71
forestgen@mail.ru
Ключевые слова: ель европейская, изменчивость, митохондриальная ДНК, хлоропластная ДНК, гаплотип, географические культуры
Страницы: 64-68
Подраздел: ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ ОБЪЕКТОВ ЛЕСНОГО ГЕНЕТИКО-СЕЛЕКЦИОННОГО КОМПЛЕКСА

Аннотация >>
Проведен генетический анализ митохондриального (мтДНК) и хлоропластного (хпДНК) геномов 27 климатипов ели европейской в географических культурах (Чериковский лесхоз, Беларусь). Установлено, что проанализированные климатипы представлены бореальным и карпатским гаплотипами мтДНК. Первый из них встречается во всех регионах произрастания климатипов (Приуральский, Северо-Западный, Центральный, Прибалтийский, Белорусский, Юго-Западный), второй — только на территории Белорусского и Юго-Западного. Показано, что уровень полиморфизма хпДНК значительно выше по сравнению с мтДНК. Для ряда аллелей локусов хпДНК обнаружена клинальная изменчивость по частотам их встречаемости. Выявлено, что отдельные гаплотипы хпДНК ели европейской подобно гаплотипам мтДНК могут быть представлены как во всех регионах исследованной части ареала, так и на определенных его территориях.


14.
ПОЭТАПНАЯ ПАСПОРТИЗАЦИЯ ДЕРЕВЬЕВ НА ОБЪЕКТАХ ГЕНЕТИКО–СЕЛЕКЦИОННОГО КОМПЛЕКСА СОСНЫ ОБЫКНОВЕННОЙ

В.В. Тараканов1, Л.И. Кальченко2, К.Г. Зацепина1,2, А.К. Экарт1, Д.Н. Шуваев2
1Институт леса им. В. Н. Сукачева СО РАН, 630082, Новосибирск, а / я 45
tarh012@mail.ru
2Центр защиты леса Алтайского края, 656056, Барнаул, ул. Пролетарская, 61
altay-lss@yandex.ru
Ключевые слова: генетическая паспортизация, клоновые плантации, сосна обыкновенная, фены, аллозимный анализ
Страницы: 69-74
Подраздел: ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ ОБЪЕКТОВ ЛЕСНОГО ГЕНЕТИКО-СЕЛЕКЦИОННОГО КОМПЛЕКСА

Аннотация >>
На клоновых плантациях сосны Pinus sylvestris L. в Алтайском крае, включающих около 1.5 тыс. деревьев 118 клонов, осуществлена поэтапная паспортизация деревьев. Паспортизация осуществлялась в 3 этапа: 1) лесоводственный (предварительный), 2) фенетический (основной), 3) молекулярно-генетический (уточняющий). Точность фенетической паспортизации составила 97.1 %. Заключительный этап паспортизации осуществлялся с учетом выявленных «фенетических кластеров» внутри клонов. Внутри кластеров сопоставлялись одно- и многораметные (смешанные) образцы, которые при отсутствии ошибок в маркировке деревьев должны показывать идентичные результаты. Способ поэтапной паспортизации позволяет сократить затраты на применение дорогостоящих методов молекулярной генетики в несколько раз.


15.
МОЛЕКУЛЯРНО–ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ЛИНИЙ СОМАКЛОНАЛЬНЫХ ГЕНОТИПОВ БЕРЕЗЫ ПОВИСЛОЙ И БЕРЕЗЫ ГИБРИДНОЙ

А.В. Константинов, С.В. Пантелеев
Институт леса Национальной академии наук Беларуси, Республика Беларусь, 246001, Гомель, Пролетарская, 71
avkonstantinof@mail.ru
Ключевые слова: сомаклональная изменчивость, береза повислая, береза гибридная, RAPD-анализ, генетический паспорт
Страницы: 75-78
Подраздел: ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ ОБЪЕКТОВ ЛЕСНОГО ГЕНЕТИКО-СЕЛЕКЦИОННОГО КОМПЛЕКСА

Аннотация >>
Сомаклональная изменчивость, возникающая в процессе культивирования микрорастений древесных растений in vitro, является потенциальным источником расширения генетического разнообразия. Для исследования отобраны 20 линий регенерантов клонов березы повислой и гибридной, отличающихся рядом морфологических особенностей и интенсивностью органогенеза. Для подтверждения сомаклональной природы изменчивости и составления генетических паспортов линий березы использовали набор из пяти праймеров. Среди образцов, полученных на основе клона гибридной березы (№ 52-84/8), изменения RAPD-спектров обнаружены по праймерам UBC-106 и UBC-254. Линии клона березы повислой (№ 6-161/3) различались по праймерам UBC-268 и UBC-154. По праймеру UBC-203 различий не выявлено.


16.
ПРЕДВАРИТЕЛЬНЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ ПОЛНОГЕНОМНОГО DE NOVO СЕКВЕНИРОВАНИЯ ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ (LARIX SIBIRICA LEDEB.) И СОСНЫ КЕДРОВОЙ СИБИРСКОЙ (PINUS SIBIRICA DU TOUR)

К.В. Крутовский1,2,3,4, Н.В. Орешкова1,5, Ю.А. Путинцева1, А.А. Ибе1,6, К.О. Дейч1,6, Е.А. Шилкина1,6
1Сибирский федеральный университет, 660036, Красноярск, Академгородок, 50а/2
kkrutovsky@gmail.com
2Институт общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН, 119991, ГСП-1, Москва, ул. Губкина, 3
3Геттингенский университет, Германия, 37077, Геттинген, ул. Бюсгенвег, 2
4Техасский агро-механический университет, США, Техас, 77843, Колледж Стейшн
5Институт леса им. В. Н. Сукачева СО РАН, 660036, Красноярск, Академгородок, 50/28
oreshkova@ksc.krasn.ru
6Центр защиты леса Красноярского края, 660036, Красноярск, Академгородок, 50а/2
aaibis@mail.ru
Ключевые слова: геном, de novo секвенирование, лиственница сибирская (Larix sibirica Ledeb.), сосна кедровая сибирская (Pinus sibirica Du Tour)
Страницы: 79-83
Подраздел: ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ ДЛЯ ОЦЕНКИ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ГЕТЕРОГЕННОСТИ ПОПУЛЯЦИЙ ОСНОВНЫХ ЛЕСООБРАЗУЮЩИХ ВИДОВ

Аннотация >>
В результате секвенирования ядерной ДНК сибирской лиственницы (Larix sibirica Ledeb.) и сосны кедровой сибирской (Pinus sibirica Du Tour) с помощью высокопроизводительного секвенатора Illumina HiSeq2000 и последующей первичной обработки данных для лиственницы получено 2 906 977 265 высококачественных парноконцевых нуклеотидных сиквенсов (чтений) генома и просеквенировано (прочитано) 576 млрд пар нуклеотидных оснований (п. н. о.), что соответствует 48–кратной длине генома лиственницы (48Х покрытие), равного 12.03 млрд п. н. о., а для кедра получено 3 427 566 813 чтений генома (679 млрд п. н. о.), что соответствует 29–кратной длине (29Х покрытие) генома кедра (23.6 млрд п. н. о.). Этих данных пока недостаточно для полной сборки и аннотации данных геномов, но полученные нуклеотидные сиквенсы уже позволили обнаружить и разработать эффективные высокополиморфные молекулярно-генетические маркеры, микросателлитные локусы, необходимые для популяционно-генетических исследований и идентификации происхождения древесины. Также продолжаются исследования однонуклеотидных полиморфизмов (так называемых «снипов»). Кроме того, геномные исследования российских бореальных лесов и связанных с ними фитопатогенов позволят обнаружить биомаркеры для решения важных научных и хозяйственных задач по сохранению лесных генетических ресурсов и селекции более устойчивых к заболеваниям и неблагоприятным факторам среды пород с ускоренным ростом и улучшенной древесиной.


17.
ПРИМЕНЕНИЕ РАЗЛИЧНЫХ ТИПОВ ГЕНЕТИЧЕСКИХ МАРКЕРОВ ДЛЯ ОЦЕНКИ УРОВНЯ ВНУТРИВИДОВОЙ ДИФФЕРЕНЦИАЦИИ ЕЛИ СИБИРСКОЙ

А.К. Экарт1, С.А. Семерикова2, В.Л. Семериков2, А.Н. Кравченко1, О.С. Дымшакова2, А.Я. Ларионова1
1Институт леса им. В. Н. Сукачева СО РАН, 660036, Красноярск, Академгородок, 50/28
ekart@pochta.ru
2Институт экологии растений и животных УрО РАН, 620144, Екатеринбург, ул. 8 Марта, 202
s.a.semerikova@ipae.uran.ru
Ключевые слова: ель сибирская, изоферменты, микросателлиты ядерной и хлоропластной ДНК, генетическое разнообразие, дифференциация
Страницы: 84-91
Подраздел: ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ ДЛЯ ОЦЕНКИ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ГЕТЕРОГЕННОСТИ ПОПУЛЯЦИЙ ОСНОВНЫХ ЛЕСООБРАЗУЮЩИХ ВИДОВ

Аннотация >>
На основании анализа изменчивости изоферментных и микросателлитных локусов ядерной и хлоропластной ДНК получены данные о степени дифференциации ряда популяций ели сибирской (Picea obovata Ledeb.), включая изолированные популяции, расположенные на о-ве Ольхон, в заповеднике Богд–Уул (Монголия) и на юге Магаданской области. Показано, что совместное использование разных типов генетических маркеров дает возможность получить более полную и объективную информацию о генетическом разнообразии и внутривидовой дифференциации этого широко распространенного в Сибири вида.


18.
ВНУТРИВИДОВАЯ ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ ЛИСТВЕННИЦЫ КАЯНДЕРА НА СЕВЕРО–ВОСТОКЕ АЗИИ

Н.В. Орешкова
Институт леса им. В. Н. Сукачева СО РАН, 660036, Красноярск, Академгородок, 50/28
oreshkova@ksc.krasn.ru
Ключевые слова: лиственница Каяндера (Larix cajanderi), маркеры ядерного генома, полиморфизм, аллельное разнообразие, генетическая структура, внутривидовая дифференциация
Страницы: 92-98
Подраздел: ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ ДЛЯ ОЦЕНКИ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ГЕТЕРОГЕННОСТИ ПОПУЛЯЦИЙ ОСНОВНЫХ ЛЕСООБРАЗУЮЩИХ ВИДОВ

Аннотация >>
Исследование внутривидовой генетической дифференциации лиственницы Каяндера (Larix cajanderi) с помощью восьми ядерных микросателлитных локусов проведено на северо-востоке Азии — в Магаданской области и на п-ове Камчатка. SSR-анализ выявил высокий уровень генетического разнообразия. Значительные генетические различия между выборками из Магаданской области и Камчатки указывают на раннюю изоляцию лиственницы на полуострове.


19.
О ВЫБОРКАХ В ИССЛЕДОВАНИЯХ ВНУТРИВИДОВОГО ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ СОСНЫ ОБЫКНОВЕННОЙ

И.В. Тихонова1, В.Л. Семериков2, С.А. Семерикова2, О.С. Дымшакова2, К.Г. Зацепина1
1Институт леса им. В. Н. Сукачева СО РАН, 660036, Красноярск, Академгородок, 50/ 28
selection@ksc.krasn.ru
2Институт экологии растений и животных УрО РАН, 620144, Екатеринбург, ул. 8 Марта, 202
semerikov@ipae.uran.ru
Ключевые слова: выборки, генетическое разнообразие, сосна обыкновенная (Pinus sylvestris L.)
Страницы: 99-109
Подраздел: ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ ДЛЯ ОЦЕНКИ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ГЕТЕРОГЕННОСТИ ПОПУЛЯЦИЙ ОСНОВНЫХ ЛЕСООБРАЗУЮЩИХ ВИДОВ

Аннотация >>
Исследовано влияние величины выборки на результаты оценок генетического разнообразия популяций сосны обыкновенной (Pinus sylvestris L.) по изменчивости 12 полиморфных локусов изоферментов и четырех микросателлитных локусов (cpSSR). Установлено, что увеличение выборки до 100 деревьев и более на популяцию приводит к существенному увеличению показателей как аллозимного разнообразия (по числу аллелей и генотипов), так и разнообразия гаплотипов хлоропластной ДНК (микросателлитных локусов cpSSR), к сокращению межпопуляционных генетических дистанций Nei без существенного изменения параметров, характеризующих генетическую структуру вида. Cтандартные объемы выборок позволяют адекватно оценить популяционную генетическую структуру вида, но недостаточны для изучения его внутрипопуляционного разнообразия.


20.
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ И ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ ЛИСТВЕННИЦ КАМЧАТКИ, САХАЛИНА И КУРИЛ

И.Ю. Адрианова
Биолого-почвенный институт ДВО РАН, 690022, Владивосток, просп. 100-летия Владивостока, 159
adrianova@biosoil.ru
Ключевые слова: лиственница (Larix), RAPD-анализ, генетическая изменчивость, дифференциация, AMOVA, Камчатка, Сахалин, Курильские острова
Страницы: 110-116
Подраздел: ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ ДЛЯ ОЦЕНКИ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ГЕТЕРОГЕННОСТИ ПОПУЛЯЦИЙ ОСНОВНЫХ ЛЕСООБРАЗУЮЩИХ ВИДОВ

Аннотация >>
Методом RAPD исследованы генетическая изменчивость и дифференциация 10 популяций лиственниц Камчатки, Сахалина и Курил. На основе анализа 319 RAPD локусов, полученных с использованием девяти произвольных праймеров, показано, что камчатские выборки характеризуются более высокими показателями генетической изменчивости (He = 0.172, P95 = 43.0 %) по сравнению с сахалинскими и итурупскими выборками (He = 0.142, P95 = 39.5 % и He = 0.143, P95 = 41.1 % соответственно). Выявлена значительная генетическая подразделенность популяций лиственниц Сахалина (GST = 0.24) и Камчатки (GST = 0.25). Обнаружена достоверная корреляция генетических и географических дистанций между выборками (r = 0.68, p < 0.005).


21.
РЕЗОЛЮЦИЯ первого Международного совещания-семинара В«Молекулярная генетика в практике лесного хозяйства: состояние, проблемы и перспективы примененияВ» (28–29 мая 2014 г., г. Москва, Россия)


Страницы: 117-119
Подраздел: РЕЗОЛЮЦИЯ