Издательство СО РАН

Издательство СО РАН

Адрес Издательства СО РАН: Россия, 630090, а/я 187
Новосибирск, Морской пр., 2

soran2.gif

Baner_Nauka_Sibiri.jpg


Яндекс.Метрика

Array
(
    [SESS_AUTH] => Array
        (
            [POLICY] => Array
                (
                    [SESSION_TIMEOUT] => 24
                    [SESSION_IP_MASK] => 0.0.0.0
                    [MAX_STORE_NUM] => 10
                    [STORE_IP_MASK] => 0.0.0.0
                    [STORE_TIMEOUT] => 525600
                    [CHECKWORD_TIMEOUT] => 525600
                    [PASSWORD_LENGTH] => 6
                    [PASSWORD_UPPERCASE] => N
                    [PASSWORD_LOWERCASE] => N
                    [PASSWORD_DIGITS] => N
                    [PASSWORD_PUNCTUATION] => N
                    [LOGIN_ATTEMPTS] => 0
                    [PASSWORD_REQUIREMENTS] => Пароль должен быть не менее 6 символов длиной.
                )

        )

    [SESS_IP] => 3.236.68.118
    [SESS_TIME] => 1627990847
    [BX_SESSION_SIGN] => 9b3eeb12a31176bf2731c6c072271eb6
    [fixed_session_id] => 934d23df07c279cef208c828578c361f
    [SALE_USER_ID] => 0
    [UNIQUE_KEY] => 641295166c37b2975b583546f68711c5
    [BX_LOGIN_NEED_CAPTCHA_LOGIN] => Array
        (
            [LOGIN] => 
            [POLICY_ATTEMPTS] => 0
        )

)

Поиск по журналу

Сибирский лесной журнал

2020 год, номер 4

ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПОЛИМОРФИЗМ ЛОКУСА mtCOI ВЕРШИННОГО КОРОЕДА Ips acuminatus Gyll. В БЕЛОРУССКИХ ПОПУЛЯЦИЯХ

С.В. Пантелеев1, Л.В. Можаровская1, О.Ю. Баранов1, В.А. Ярмолович2, В.Е. Падутов1
1Институт леса Национальной академии наук Беларуси, Гомель, Республика Беларусь
stasikdesu@mail.ru
2Белорусский государственный технологический университет, Минск, Республика Беларусь
yarm@belstu.by
Ключевые слова: митохондриальная ДНК, гаплотип, секвенирование, mitochondrial DNA, haplotype, sequencing
Страницы: 15-29

Аннотация

В ходе молекулярно-генетических исследований проведены секвенирование и аннотация митохондриального генома вершинного короеда Ips acuminatus Gyll., включая баркодинговый маркер насекомых - ген субъединицы I митохондриальной цитохром с-оксидазы ( mtcoI ). По результатам сравнительной оценки уровня полиморфизма среди генов мтДНК установлено, что mtcoI характеризуется средним уровнем изменчивости. Предварительное изучение белорусских популяций вершинного короеда позволило идентифицировать 18 гаплотипических вариантов по маркерному локусу mtCOI (фрагмент гена mtcoI ). При этом значительная часть исследованных особей (50 %) характеризовалась наличием гетероплазмии - содержала в геноме не менее двух гаплотипов маркерного локуса одновременно. Изучение уровня генетической дифференциации между гаплотипами с использованием моделей Джукса-Кантора (JC) и Кимуры (К80) выявило широкий диапазон варьирования значений показателя эволюционной дистанции D - от 0.001 до 0.066, что соответствовало 1-46 нуклеотидным заменам на исследуемый регион (690 н. o.) у отдельных гаплотипов. Анализ транслируемых последовательностей mtCOI-локуса вершинного короеда с использованием технологии 3D-моделирования показал, что доменная архитектура белка - субъединицы 1 цитохром с-оксидазы остается для большинства (94 %) гаплотипов неизменной и функциональность аллоферментов не нарушается, что свидетельствует об относительно нейтральном характере выявляемой изменчивости. На основании полученных совокупных молекулярно-генетических данных сделан вывод, что степень информативности ДНК-маркера mtCOI является достаточной для проведения популяционно-генетических исследований вершинного короеда, включая оценку его миграционной активности.

DOI: 10.15372/SJFS20200403
Добавить в корзину
Товар добавлен в корзину