Выделение суммарной бактериальной ДНК для экологической характеристики донных осадков озера Байкал
С. М. Черницына, О. В. Шубенкова, Т. И. Земская, М. А. Грачев, А. Л. Верещагин, Т. Я. Косторнова
Лимнологический институт СО РАН 664033 Иркутск, ул. Улан-Баторская, 3
Страницы: 717-723
Аннотация
Известно, что традиционные микробиологические методы исследования позволяют выявить не более 1 % видов микроорганизмов, реально населяющих тот или иной биотоп. Наиболее полная характеристика микробного сообщества осуществляется при исследовании ДНК, выделенной из различных по экологическим условиям образцов. Осадки оз. Байкал характеризуются высоким содержанием гуминовых соединений, препятствующих проведению молекулярно-биологических анализов. Поэтому процедура выделения ДНК является критическим шагом при анализе донного осадка. В данной работе нами проведено сравнение методов выделения суммарной бактериальной ДНК из донных осадков оз. Байкал. Подобран наиболее эффективный способ, позволяющий получить препараты ДНК для проведения дальнейших молекулярных исследований.
|
