Исследование бактериального сообщества гнездовой подстилки из нор длиннохвостого суслика методом метагеномного анализа
Е.Г. Токмакова1, Н.Ф. Галацевич2, А.С. Пономарева1, С.В. Эрдынеев1, А.А. Чалбакай2, И.С. Акимова2, С.В. Балахонов1
1Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока Роспотребнадзора, Иркутск, Россия
flea98@mail.ru
2Тувинская противочумная станция, Кызыл, Россия
pchs@tuva.ru
Ключевые слова: бактериальное сообщество, метагеномный анализ, длиннохвостый суслик, гнездо
Страницы: 131-140
Аннотация
Приведены результаты паразитологического и метагеномного исследования двух гнезд длиннохвостого суслика, добытых в Тувинском горном очаге чумы (Монгун-Тайгинский кожуун Республики Тыва). Фауна кровососущих членистоногих обоих гнезд образована блохами Citellophilus tesquorum Wagn., Frontopsylla elatoides Wagn., Rhadinopsylla li transbaikalica Ioff et Tifl., Oropsylla alaskensis Baker, Neopsylla mana Wagn. и клещами Haemogamasus mandschuricus Vitzthum и Hg. hodosi Goncharova et Buyakova. В гнезде № 1 единично присутствовали F. hetera Wagn., F. frontalis baikal Ioff. По размерам, глубине залегания, длине хода до гнездовой камеры, видовому составу и физиологическому состоянию эктопаразитов гнезда определены как зимовочное (№ 1) и запасное (№ 2). По результатам метагеномного анализа в сообществе гнезда № 1 представлены филы Proteobacteria - 64,2 % (доминирующие роды Allorhizobium - 22,8 %, Aureimonas - 9,71 %, Methylobacterium - 7,68 %), Actinobacteria - 35 % (из них Brachybacterium - 3,8 %, Amycolatopsis - 3,33 %, Brevibacterium - 1,76 %), Firmicutes (Staphylococcus) - 0,8 %. В пробе из гнезда № 2 к филе Actinobacteria принадлежали 87,1 % секвенированных последовательностей (Brachybacterium - 51,0 %, Brevibacterium - 19,6 %, Nocardioides - 7,4 %), Firmicutes (Staphylococcus) - 12,8 %, Proteobacteria (Methylobacterium) - 0,08 %. Обсуждаются возможные причины отличий в составе бактериальных сообществ гнезд.
DOI: 10.15372/SEJ20260109 |
