Изменчивость генетических nSSR-маркеров в антропогенно-нарушенных популяциях сосны обыкновенной Средней и Западной Сибири: методические аспекты генетического мониторинга
И.В. Тихонова1, А.К. Экарт2, А.Н. Кравченко2, К.Г. Хомутова1, Н.А. Тихонова2
1Западно-Сибирское отделение Института леса им. В. Н. Сукачева СО РАН (ФИЦ КНЦ СО РАН), Новосибирск, Россия
selection@ksc.krasn.ru
2Институт леса им. В. Н. Сукачева СО РАН (ФИЦ КНЦ СО РАН), Красноярск, Россия
Ключевые слова: сосна обыкновенная, генетическое разнообразие, ядерные микросателлитные маркеры, антропогенные факторы, Сибирь
Страницы: 613-625
Аннотация
Представлены результаты анализа ядерных микросателлитных локусов (nSSR) для изучения генетического разнообразия естественных популяций сосны обыкновенной (Pinus sylvestris L.) в южной тайге и лесостепи Средней и Западной Сибири, подверженных влиянию пожаров и рубок разной интенсивности. Отобрано шесть полиморфных локусов, пригодных для изучения генетической изменчивости популяций вида в Сибири. Используемый нами набор генетических маркеров в сибирской части ареала вида ранее не исследовался. Проведены популяционно-генетические исследования 13 сибирских популяций сосны обыкновенной (26 выборок) на основе отобранных nSSR-маркеров (psyl57, PtTx2146, lw_isotig04195, lw_isotig04306. lw_isotig10603, lw_isotig21953), содержащих в сумме 62 аллеля, 15 из них встречались только в какой-либо одной (двух) популяции, и могут быть использованы для изучения пространственно-популяционной структуры вида и определения географических границ популяций. Установлено, что их изменчивость существенно выше по сравнению с изоферментными маркерами, они содержат значительное число редких и очень редких аллелей и достаточно информативны для целей генетического мониторинга и оценки влияния лесохозяйственной деятельности и других естественных и антропогенных повреждающих факторов на внутрипопуляционное генетическое разнообразие и устойчивость одного из основных лесообразующих хвойных видов Сибири. При анализе сходства популяций вида по исследуемым маркерам выявлена определенная связь между генетической дифференциацией популяций и их географическим положением, часто не обнаруживаемая при использовании изоферментных маркеров.
DOI: 10.15372/SEJ20230504
EDN: PHYWOL
|
