Автохтонные бактериофаги в структуре “микробной петли” различных биотопов озера Байкал
В.В. Дрюккер1, О.И. Белых1, А.С. Горшкова1, А.А. Бондарь2, Н.Н. Сыкилинда3
1Лимнологический институт СО РАН, 664033, Иркутск, ул. Улан-Баторская, 3 drucker@lin.irk.ru 2ЦКП “Геномика” Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, 630090, Новосибирск, просп. Академика Лаврентьева, 8 alex.bondar@mail.ru 3Институт биоорганической химии им. акад. М. М. Шемякина и акад. Ю. А. Овчинникова РАН, 117997, Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10 sykilinda@mail.ru
Ключевые слова: бактериофаги, Байкал, морфотипы, численность, планктон, нейстон, биопленки, bacteriophages, Lake Baikal, morphotypes, abundance, plankton, neuston, biofilms
Страницы: 177-191
Аннотация
В статье представлены результаты изучения автохтонных бактериофагов - ранее неизвестного звена в структуре “микробной петли” экосистемы глубоководного олиготрофного оз. Байкал. Методом трансмиссионной электронной микроскопии исследовано морфологическое разнообразие фагов водной толщи, поверхностного микрослоя воды и бентосных биопленок, образовавшихся на границе вода - геологические породы (мрамор, гранит, слюда, кварц, амфиболит, габбро, уртит). Представлены данные по размерной структуре автохтонных бактериофагов, их численности, сезонной динамике и вертикальному распределению от поверхности до максимальных глубин - 1200 м в сравнении с содержанием бактерий. Выделены и охарактеризованы молекулярно-генетическими методами несколько морфотипов байкальских автохтонных бактериофагов, поражающих Pseudomonаs aeruginosa . Определены полные геномы гигантского фага PaBG семейства Myoviridae и фага MD8 семейства Siрhoviridae.
DOI: 10.15372/SEJ20190203 |