К гидродинамической интерпретации процесса укладки α-спирального белка
В.А. Андрющенко1,2, С.Ф. Чекмарев1,2 1Институт теплофизики им. С.С. Кутателадзе СО РАН, Новосибирск chekmarev@itp.nsc.ru 2Новосибирский государственный университет, Новосибирск
Ключевые слова: α-спиральный белок, процесс укладки, потоки укладки, турбулентность
Страницы: 979-982
Аннотация
С использованием метода молекулярной динамики проведено моделирование укладки белка в виде α-спиральной шпильки из развернутого состояния в компактное функциональное (нативное) состояние. Процесс укладки интерпретируется как стационарное движение сжимаемой «жидкости укладки». Показано, что плотности потоков укладки подчиняются тем же соотношениям подобия, что и скорости несжимаемой жидкости в классической теории турбулентности Колмогорова, с той разницей, что роль ключевого параметра, представляющего собой скорость изменения кинетической энергии на единицу массы жидкости, играет скорость изменения дисперсии потоков на единицу объема.
Наш сайт использует куки. Продолжая им пользоваться, вы соглашаетесь на обработку персональных данных в соответствии с политикой конфиденциальности. Подробнее