Издательство СО РАН

Издательство СО РАН

Адрес Издательства СО РАН: Россия, 630090, а/я 187
Новосибирск, Морской пр., 2

soran2.gif

Baner_Nauka_Sibiri.jpg


Яндекс.Метрика

Поиск по журналу

Биологическое действие низкоинтенсивного лазерного излучения: пути регуляции растительного метаболизма. Ч. 2

2009 год, номер 5

МОДЕЛИРОВАНИЕ КОМПЛЕКСОВ ИЗОФОРМЫ 1A2 ЦИТОХРОМА P450 С СУБСТРАТАМИ

А. А. Погребной1, М. А. Гришина2, В. А. Потемкин3
1 Челябинский государственный университет, alpha@74mail.ru
2 Челябинский государственный университет
3 Челябинский государственный университет
Ключевые слова: докинг, моделирование, комплекс, субстрат, РСА, P450, 1A2, 2HI4
Страницы: 852-858

Аннотация

С применением 3D-QSAR алгоритма CiS проведено моделирование комплексов 17 субстратов с изоформой 1A2 цитохрома P450 при использовании в качестве основы для моделирования комплекса 2HI4 из базы данных PDB. Рассмотрено расположение молекул субстратов в полости изоформы 1A2, проанализирована ориентация реакционных центров молекул относительно гема и исследован характер взаимодействия между субстратами и аминокислотными остатками активного сайта. Структуры полученных при моделировании комплексов позволяют объяснять направление метаболизма в случае реакций деметилирования и ряда реакций гидроксилирования, что делает возможным применение алгоритма CiS для прогнозирования направления процессов метаболизма.