Потребление аминокислот некультивируемым бактериопланктоном эвтрофного водохранилища
О. В. Колмакова1, М. Ю. Трусова2
1 Сибирский федеральный университет 2 Институт биофизики СО РАН mtrusova@ibp.krasn.ru
Ключевые слова: свободноживущий некультивируемый бактериопланктон, аминокислоты, ПЦР-ДГГЭ, микроэкосистемы, 16S рибосомальная РНК
Страницы: 13-21
Аннотация
В экспериментальных микроэкосистемах выявлены c использованием нестерильного культивирования виды (клоны) бактериопланктона водохранилища, питающиеся лизином и глицином. Структуру сообщества анализировали, применяя метод разделения амплифицированных фрагментов гена 16S рРНК бактерий в условиях денатурирующего градиентного гель-электрофореза. Идентификация доминирующих видов (клонов) бактериопланктона проведена с использованием молекулярного клонирования и определения нуклеотидной последовательности участка гена 16S рибосомальной РНК. Обнаружено, что глицин - одна из превалирующих аминокислот эвтрофного водоема, и лизин, чье содержание в природной воде более низкое, служили питательными субстратами для разных субдоминантных видов (клонов) бактериопланктона. Таким образом, установлено, что виды свободноживущего бактериопланктона являются узкоспециализированными по потреблению отдельных аминокислот.
|